Project

General

Profile

Install Adaguc on Ubuntu » History » Version 73

Maarten Plieger, 02/15/2019 02:53 PM

1 48 Maarten Plieger
h1. Install Adaguc Server and Adaguc Viewer on Ubuntu LTS 16.04.2
2 27 Maarten Plieger
3 72 Maarten Plieger
h2. The following repositories are used:
4 72 Maarten Plieger
5 54 Maarten Plieger
* https://github.com/KNMI/adaguc-services - Java application for running adaguc-server from tomcat or as a spring boot application
6 53 Maarten Plieger
* https://github.com/KNMI/adaguc-server - C++ server for serving WMS, WCS and OpenDAP
7 53 Maarten Plieger
* https://github.com/KNMI/adaguc-viewer - Javascript web client for connecting to WMS
8 53 Maarten Plieger
9 53 Maarten Plieger
10 1 Maarten Plieger
This procedure was followed to create the ADAGUC VM image: 
11 1 Maarten Plieger
12 72 Maarten Plieger
h2. Install packages
13 72 Maarten Plieger
14 26 Maarten Plieger
<pre>
15 49 Maarten Plieger
sudo apt-get -y install vim kate kwrite konsole g++ m4 ncview curl git
16 49 Maarten Plieger
sudo apt-get -y  install postgresql postgresql-server-dev-all postgresql-client postgresql-client-common  postgresql-contrib 
17 49 Maarten Plieger
sudo apt-get -y install libcurl4-openssl-dev libcairo2-dev libxml2-dev libgd2-xpm-dev libudunits2-dev udunits-bin netcdf-bin libnetcdf-dev libhdf5-dev libproj-dev libgdal-dev 
18 49 Maarten Plieger
sudo apt-get -y install default-jre default-jdk maven
19 1 Maarten Plieger
sudo apt-get -y install chromium-browser
20 1 Maarten Plieger
</pre> 
21 1 Maarten Plieger
22 72 Maarten Plieger
h2. Setup postgresql
23 72 Maarten Plieger
24 1 Maarten Plieger
<pre>
25 56 Maarten Plieger
sudo service postgresql start
26 1 Maarten Plieger
sudo -u postgres createuser --superuser adaguc
27 1 Maarten Plieger
sudo -u postgres psql postgres -c "ALTER USER adaguc PASSWORD 'adaguc';"
28 1 Maarten Plieger
sudo -u postgres psql postgres -c "CREATE DATABASE adaguc;"
29 1 Maarten Plieger
echo "\q" | psql "dbname=adaguc user=adaguc password=adaguc host=localhost"
30 1 Maarten Plieger
if [ ${?} -eq 0 ];then
31 1 Maarten Plieger
    echo "Postgres database setup correctly"
32 1 Maarten Plieger
fi
33 29 Maarten Plieger
</pre>
34 29 Maarten Plieger
35 72 Maarten Plieger
h2. Install tomcat
36 30 Maarten Plieger
37 30 Maarten Plieger
<pre>
38 30 Maarten Plieger
sudo mkdir -p /src/
39 57 Maarten Plieger
sudo chown -R $USER: /src
40 30 Maarten Plieger
cd /src/
41 55 Maarten Plieger
curl -L https://archive.apache.org/dist/tomcat/tomcat-8/v8.0.44/bin/apache-tomcat-8.0.44.tar.gz > apache-tomcat-8.0.44.tar.gz
42 30 Maarten Plieger
tar -xzvf apache-tomcat-8.0.44.tar.gz
43 30 Maarten Plieger
44 30 Maarten Plieger
printf "export CATALINA_HOME=\"/src/apache-tomcat-8.0.44\"\n\
45 30 Maarten Plieger
export CATALINA_BASE=\"/src/apache-tomcat-8.0.44\"\n\
46 30 Maarten Plieger
export ADAGUC_SERVICES_CONFIG=/src/config/adaguc-services-config-tomcat.xml\n\
47 30 Maarten Plieger
export JAVA_HOME=\"/usr\"\n\
48 30 Maarten Plieger
CONTENT_ROOT=-Dtds.content.root.path=/src/apache-tomcat-8.0.44/content\n\
49 30 Maarten Plieger
JAVA_PREFS_ROOTS=\"-Djava.util.prefs.systemRoot=$CATALINA_HOME/content/thredds/javaUtilPrefs -Djava.util.prefs.userRoot=$CATALINA_HOME/content/thredds/javaUtilPrefs\"\n\
50 30 Maarten Plieger
NORMAL=\"-d64 -Xmx4096m -Xms512m -server -ea\"\n\
51 30 Maarten Plieger
HEAP_DUMP=\"-XX:+HeapDumpOnOutOfMemoryError\"\n\
52 30 Maarten Plieger
HEADLESS=\"-Djava.awt.headless=true\"\n\
53 1 Maarten Plieger
JAVA_OPTS=\"$CONTENT_ROOT $NORMAL $MAX_PERM_GEN $HEAP_DUMP $HEADLESS $JAVA_PREFS_ROOTS\"\n\
54 30 Maarten Plieger
export JAVA_OPTS" > /src/apache-tomcat-8.0.44/setenv.sh
55 30 Maarten Plieger
56 30 Maarten Plieger
</pre>
57 30 Maarten Plieger
58 72 Maarten Plieger
h2. Install adaguc-services
59 73 Maarten Plieger
60 30 Maarten Plieger
<pre>
61 30 Maarten Plieger
sudo mkdir -p /src/KNMI
62 58 Maarten Plieger
sudo chown -R $USER: /src
63 32 Maarten Plieger
mkdir -p /src/config
64 32 Maarten Plieger
sudo mkdir -p /data
65 60 Maarten Plieger
sudo chown -R $USER: /data
66 32 Maarten Plieger
mkdir -p /data/adaguc-services-base
67 32 Maarten Plieger
mkdir -p /data/adaguc-services-space
68 36 Maarten Plieger
mkdir -p /src/log/
69 30 Maarten Plieger
cd /src/KNMI
70 30 Maarten Plieger
git clone https://github.com/KNMI/adaguc-services
71 30 Maarten Plieger
cd /src/KNMI/adaguc-services
72 30 Maarten Plieger
mvn package
73 61 Maarten Plieger
cp ./target/adaguc-services-*.war /src/apache-tomcat-8.0.44/webapps/adaguc-services.war
74 32 Maarten Plieger
75 32 Maarten Plieger
76 32 Maarten Plieger
# Configure adaguc-services
77 1 Maarten Plieger
printf "<?xml version=\"1.0\" encoding=\"UTF-8\"?>\n\
78 32 Maarten Plieger
<adaguc-services>\n\
79 34 Maarten Plieger
  <external-home-url>http://localhost:8080/adaguc-services/</external-home-url>\n\
80 32 Maarten Plieger
  <basedir>/data/adaguc-services-base</basedir>\n\
81 32 Maarten Plieger
  <userworkspace>/data/adaguc-services-space</userworkspace>\n\
82 32 Maarten Plieger
  <server>\n\
83 32 Maarten Plieger
    <port>8080</port>\n\
84 32 Maarten Plieger
  </server>\n\
85 32 Maarten Plieger
  <security>\n\
86 32 Maarten Plieger
    <keystore>/src/keystore.jks</keystore>\n\
87 32 Maarten Plieger
    <keystorepassword>password</keystorepassword>\n\
88 32 Maarten Plieger
    <keystoretype>JKS</keystoretype>\n\
89 1 Maarten Plieger
    <keyalias>tomcat</keyalias>\n\
90 1 Maarten Plieger
  </security>\n\
91 32 Maarten Plieger
  <adaguc-server>\n\
92 34 Maarten Plieger
    <adagucexecutable>/src/KNMI/adaguc-server/bin/adagucserver</adagucexecutable>\n\
93 34 Maarten Plieger
    <export>ADAGUC_PATH=/src/KNMI/adaguc-server/</export>\n\
94 38 Maarten Plieger
    <export>ADAGUC_CONFIG=/src/KNMI/adaguc-server/data/config/adaguc.vm.xml</export>\n\
95 32 Maarten Plieger
    <export>ADAGUC_DATARESTRICTION=FALSE</export>\n\
96 34 Maarten Plieger
    <export>ADAGUC_FONT=/src/KNMI/adaguc-server/data/fonts/FreeSans.ttf</export>\n\
97 37 Maarten Plieger
    <export>ADAGUC_LOGFILE=/src/log/adaguc-server.log</export>\n\
98 32 Maarten Plieger
  </adaguc-server>\n\
99 52 Maarten Plieger
  <autowms>\n\
100 52 Maarten Plieger
    <enabled>true</enabled>\n\
101 52 Maarten Plieger
    <autowmspath>/data/adaguc-autowms/</autowmspath>\n\
102 1 Maarten Plieger
    <datasetpath>/data/adaguc-datasets/</datasetpath>\n\
103 1 Maarten Plieger
  </autowms>\n\
104 52 Maarten Plieger
</adaguc-services>" > /src/config/adaguc-services-config-tomcat.xml
105 33 Maarten Plieger
106 32 Maarten Plieger
</pre>
107 30 Maarten Plieger
108 72 Maarten Plieger
h2. Install adaguc-viewer
109 72 Maarten Plieger
110 30 Maarten Plieger
<pre>
111 30 Maarten Plieger
cd /src/apache-tomcat-8.0.44/webapps
112 30 Maarten Plieger
git clone https://github.com/KNMI/adaguc-viewer/
113 1 Maarten Plieger
printf "\n\
114 1 Maarten Plieger
xml2jsonrequestURL = '/adaguc-services/xml2json?'\n\
115 30 Maarten Plieger
autowmsURL = '/adaguc-services/autowms?';\n\
116 51 Maarten Plieger
getFeatureInfoApplications.push({name:'AutoWMS',iconCls:'button_getfeatureinfo'});\n\
117 51 Maarten Plieger
" >> adaguc-viewer/config.js
118 30 Maarten Plieger
</pre>
119 30 Maarten Plieger
120 72 Maarten Plieger
h2. Install adaguc-server
121 72 Maarten Plieger
122 29 Maarten Plieger
<pre>
123 1 Maarten Plieger
sudo mkdir -p /src/KNMI
124 60 Maarten Plieger
sudo chown -R $USER: /src
125 33 Maarten Plieger
sudo mkdir -p /data/
126 33 Maarten Plieger
sudo chown -R $USER: /data
127 33 Maarten Plieger
mkdir /data/adaguc-autowms
128 29 Maarten Plieger
mkdir /data/adaguc-datasets
129 1 Maarten Plieger
cd /src/KNMI
130 1 Maarten Plieger
git clone https://github.com/KNMI/adaguc-server
131 1 Maarten Plieger
cd /src/KNMI/adaguc-server
132 1 Maarten Plieger
bash compile.sh
133 1 Maarten Plieger
cp /src/KNMI/adaguc-server/data/datasets/testdata.nc /data/adaguc-autowms/
134 40 Maarten Plieger
cp /src/KNMI/adaguc-server/data/config/datasets/dataset_a.xml /data/adaguc-datasets/
135 35 Maarten Plieger
136 1 Maarten Plieger
</pre>
137 29 Maarten Plieger
138 72 Maarten Plieger
h2. Automate Start tomcat
139 72 Maarten Plieger
140 34 Maarten Plieger
<pre>
141 42 Maarten Plieger
echo -e '#!/bin/bash
142 42 Maarten Plieger
t=`ps -ef | grep apache-tomcat-8 | grep adaguc | grep -v grep`
143 42 Maarten Plieger
if [ ! -z "$t" -a "$t" != " " ]; then
144 42 Maarten Plieger
        echo "Tomcat is running"
145 42 Maarten Plieger
else
146 42 Maarten Plieger
  echo "Tomcat is not running, starting it"
147 42 Maarten Plieger
  . /src/apache-tomcat-8.0.44/setenv.sh
148 42 Maarten Plieger
  /src/apache-tomcat-8.0.44/bin/startup.sh
149 42 Maarten Plieger
  sleep 2
150 1 Maarten Plieger
fi' > /src/tomcatstarter.sh
151 42 Maarten Plieger
chmod +x /src/tomcatstarter.sh
152 42 Maarten Plieger
/src/tomcatstarter.sh
153 42 Maarten Plieger
154 44 Maarten Plieger
echo -e '@reboot /src/tomcatstarter.sh  > /dev/null 2>&1' > /src/crontab
155 42 Maarten Plieger
crontab /src/crontab
156 42 Maarten Plieger
157 1 Maarten Plieger
</pre>
158 42 Maarten Plieger
159 72 Maarten Plieger
h2. Check if it is working
160 1 Maarten Plieger
161 1 Maarten Plieger
Visit for files in /data/adaguc-autowms:
162 45 Maarten Plieger
* http://localhost:8080/adaguc-viewer/?service=http%3A%2F%2Flocalhost%3A8080%2Fadaguc-services%2Fadagucserver%3Fservice%3Dwms%26request%3Dgetcapabilities%26source%3Dtestdata.nc
163 45 Maarten Plieger
Visit for datasets in /data/adaguc-datasets:
164 45 Maarten Plieger
* http://localhost:8080/adaguc-viewer/?service=http%3A%2F%2Flocalhost%3A8080%2Fadaguc-services%2Fadagucserver%3Fservice%3Dwms%26request%3Dgetcapabilities%26dataset%3Ddataset_a
165 62 Maarten Plieger
166 65 Maarten Plieger
167 71 Maarten Plieger
h2. Update datasets
168 70 Maarten Plieger
169 67 Maarten Plieger
Dataset configurations [[Dataset]] can be configured via path /src/KNMI/adaguc-server/data/config/datasets. Data configured in these dataset configurations need to be scanned via an updatedb command:
170 64 Maarten Plieger
171 1 Maarten Plieger
<pre>
172 65 Maarten Plieger
# Update of dataset  /src/KNMI/adaguc-server/data/config/datasets/dataset_a.xml
173 62 Maarten Plieger
export ADAGUC_TMP=/tmp
174 1 Maarten Plieger
export ADAGUC_PATH=/src/KNMI/adaguc-server/
175 1 Maarten Plieger
/src/KNMI/adaguc-server/bin/adagucserver --updatedb --config /src/KNMI/adaguc-server/data/config/adaguc.vm.xml,dataset_a.xml
176 64 Maarten Plieger
177 64 Maarten Plieger
</pre>
178 26 Maarten Plieger
179 26 Maarten Plieger
---
180 47 Maarten Plieger
181 47 Maarten Plieger
*Please note:* The previous instructions for installing adaguc using Apache CGI and PHP can be found here: [[Install_Adaguc_on_Ubuntu_Old]]